我们经常习惯将自来水龙头直接接到加湿器的上面。虽然自来水看着是很干净的，但其实并不见得很卫生。存在病菌，水质的软硬、水中金属物质、化学物质含量的多少等因素，都会影响我们的身体健康。
    细菌会通过超声波加湿器形成的水雾直达人体，虽然不会当时出现不适的症状，但长时间积累同样会对人体健康造成一定的威胁。而加湿器潮湿的环境特别有利于细菌的生长，因此我们建议用户要经常换水，定期清洁水箱和雾化片，以减少细菌的滋生。
    如果用硬水进行加湿作业，水中所含的矿物质成分也会在周围的物体表面覆盖一层白色粉末，这就是水中金属离子形成的化合物被超声波雾化后的结果，本质类似于硬水煮沸后形成的水垢。此外由于颗粒细微，它们不仅容易附着在各种表面，同样也有可能通过呼吸道进入人体。尤其是对肺部的损伤更加严重。此外，硬水形成的水垢也很容易覆盖住加湿器核心部件：雾化片，从而降低雾化效率令加湿器失效、损坏。
    所以加湿器里最好加入纯净水。此外，还应定期对加湿器进行清洁、换水，最好一周一次。工业生产中应用的加湿器用水同样要经过处理，避免水中的杂质影响到工人的身体健康及产品的质量。